Análisis transcriptómico del musgo Physcomitrella patens bajo estrés osmótico

Resumen

El estrés abiótico más severo que afecta el desarrollo y productividad de las plantas es el osmótico, el cual puede desencadenarse por estrés hídrico, térmico y/o salino; o por sustancias como los azúcares. Para estudiar los efectos del estrés osmótico en el metabolismo, se utilizó al musgo Physcomitrella patens (P. patens), el cual presenta diferentes características, siendo una de las más importantes la información contenida en su material genético que lo posicionan como un organismo altamente tolerante a estrés abiótico. P. patens también ha sido establecido como un modelo en genómica comparativa mediante el análisis funcional, por genética inversa, de genes homólogos con aquellos previamente identificados en plantas vasculares. A través de la utilización de la tecnología RNA-seq (plataforma Illumina), se analizó el transcriptoma de protonemas de diez días de edad de P. patens sometidos a estrés osmótico por glucosa (300 mM) y sorbitol (300 mM) durante 3 hrs. Se identificaron distintas rutas metabólicas reportadas como importantes para la tolerancia a estrés. En el presente proyecto se encontraron más de 100 genes que codifican para enzimas, y se ha explorado la relación que existe entre estos genes y las vías metabólicas en las que participan mediante el uso de distintas bases de datos. La información obtenida, ayuda a entender de una mejor manera los efectos del estrés osmótico en la fisiología del organismo, además de enriquecer los datos existentes sobre el perfil de expresión génica en el musgo P. patens.